福井谦一生于很普通的家庭，是家中的独子。他自幼就喜欢玩，经常玩得浑身是泥。
1913年，福井谦一考上大阪府今宫中学。一入学就参加了学校举办的生物爱好者学会。课余时间，他常和同学们一起爬山、收集生物标本和阅读书籍。他特别喜欢阅读法布尔的《昆虫记》，其中许多感人的场面，他都反复阅读。尤其令他陶醉的是这本书的最后一节——应用化学。不知是因为精力太分散，还是别的原因，那时他的化学成绩并不好。
一天，同学们都已回家了，可福井谦一还在回家的路上徘徊，直到太阳落山了，他才无奈地推开了家门。“爸爸，今天我的化学成绩知道了。”福井谦一主动向父亲坦陈，等待严厉的训斥。当得知儿子的成绩时，父亲虽然感到十分失望，但他仍鼓励道：“孩子，没关系。
