《广东医学院学报》正式创刊于1983年1月，它的前身是《湛医通讯》、《湛江医学院科研汇编》、《湛江医学院学报》。随着湛江医学院易名为广东医学院，1993年6月经国家科委批准，《湛江医学院学报》亦相继易名为《广东医学院学报》。
《广东医学院学报》的发展史可分为三个阶段：初刊阶段（1972年1月～1982年10月）；正式刊物内部发行阶段（1983年1月～1990年12月）；正式公开发行发展阶段（1991年1月至今）。
1972年，为了学术交流的需要，将教师们的科研论文合并在一起印刷成册，初曾称之为《湛医通讯》、《湛江医学院科研汇编》，不定期印了12～13期，随后定名为《湛江医学院学报》。最初这些刊物无刊号，不经审稿，也没有编辑部和固定的编辑人员及办公场所。我们把这一时期称为初刊期。
1983年1月，原《湛江医学院学报》经广东省新闻出版事业管理局（粤新068号）批准为正式内部发行刊物（季刊）。
1990年10月经广东省新闻出版局批准[粤新函字1990第28号文]，湛江医学院学报从1991年1月起正式改为向全国公开发行。1992年9月，经广东省人民政府批准，原湛江医学院易名为广东医学院。1993年6月，经国家科委批准，《湛江医学院学报》亦相应更名为《广东医学院学报》，统一刊号为CN44－1375／R，国际统一书号为ISSN1005－4057。从此，广东医学院学报进入了一个新的发展阶段。目前，《广东医学院学报》为双月刊，每年6期，每期112页。
《广东医学院学报》一直坚持办刊宗旨，遵守和维护版权法的一切规定。坚守质量关，对每篇稿件的编辑、出版工作做到了精益求精，一丝不苟。全面执行法定计量单位，量和符号等。力求使用正确，文字表达力求准确、通顺；图表设计布局力求合理，封面、版式设计规范、合理且美观大方；印刷质量逐年提高，字体选择恰如其分。努力使学报的编排、印刷质量达到国家标准。
《广东医学院学报》对任何作者稿件的取舍，只认稿不认人，坚持“三审”（编辑初审、专家审稿、主编终审）制度，把稿件的质量放在第一位。凡对本单位的作者来稿均送到全国相应专业的专家审，而外单位的作者来稿多数送给本单位的专家审，这就避免了感情、人情审稿的误区。在稿件录用问题上，我们不怕权势所压，不为金钱所诱，凡对不符合发表的稿件坚决不予刊登。然而，对一些不熟悉如何撰写论文的医务人员，编辑部同仁都能给予热情帮助和耐心指导。
《广东医学院学报》从初刊期不定期出版、内部正式出版发行到公开发行，版本上已经脱胎换骨，从过去的活字铅印转变成电脑胶印的精致版本，版面的容载量比过去翻了两翻。尤其在论文质量，编排规范上都迈进了一大步。目前《广东医学院学报》是中国学术期刊综合评价数据库来源期刊，刊登的论文已被《中国期刊网》、《中国学术期刊（光盘版）》、《中国核心期刊（遴选）数据库》、中文科技期刊数据库、《中文生物医学期刊文献数据库-CMCC》全文收录，同时还被《中文科技资料目录》（医药卫生分册）、中国药学文摘、中国医学文摘等多家检索刊物收录。
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